MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum UCMB5033

Total Repeats: 74745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022075	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	530567813
2	NC_022075	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530567813
3	NC_022075	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567813
4	NC_022075	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	530567813
5	NC_022075	AT	3	6	419	424	50 %	50 %	0 %	0 %	530567814
6	NC_022075	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
7	NC_022075	CTGG	2	8	567	574	0 %	25 %	50 %	25 %	530567814
8	NC_022075	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
9	NC_022075	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
10	NC_022075	A	6	6	697	702	100 %	0 %	0 %	0 %	530567814
11	NC_022075	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	530567814
12	NC_022075	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
13	NC_022075	TTTA	2	8	849	856	25 %	75 %	0 %	0 %	530567814
14	NC_022075	TA	3	6	855	860	50 %	50 %	0 %	0 %	530567814
15	NC_022075	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530567814
16	NC_022075	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567814
17	NC_022075	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567814
18	NC_022075	ATA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567814
19	NC_022075	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567814
20	NC_022075	AACA	2	8	1079	1086	75 %	0 %	0 %	25 %	530567814
21	NC_022075	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
22	NC_022075	CAAA	2	8	1131	1138	75 %	0 %	0 %	25 %	530567814
23	NC_022075	CCG	2	6	1159	1164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567814
24	NC_022075	GATT	2	8	1214	1221	25 %	50 %	25 %	0 %	530567814
25	NC_022075	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567814
26	NC_022075	A	7	7	1269	1275	100 %	0 %	0 %	0 %	530567814
27	NC_022075	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567814
28	NC_022075	TCT	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567814
29	NC_022075	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
30	NC_022075	CGAA	2	8	1546	1553	50 %	0 %	25 %	25 %	530567814
31	NC_022075	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567814
32	NC_022075	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567814
33	NC_022075	GGC	2	6	1639	1644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567814
34	NC_022075	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567814
35	NC_022075	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567814
36	NC_022075	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
37	NC_022075	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567814
38	NC_022075	GAAA	2	8	1725	1732	75 %	0 %	25 %	0 %	530567814
39	NC_022075	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567814
40	NC_022075	TCG	2	6	2040	2045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567815
41	NC_022075	TCAT	2	8	2099	2106	25 %	50 %	0 %	25 %	530567815
42	NC_022075	AGA	2	6	2113	2118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567815
43	NC_022075	TGA	2	6	2119	2124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567815
44	NC_022075	CGAT	2	8	2139	2146	25 %	25 %	25 %	25 %	530567815
45	NC_022075	TGC	2	6	2163	2168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567815
46	NC_022075	TTC	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567815
47	NC_022075	A	6	6	2195	2200	100 %	0 %	0 %	0 %	530567815
48	NC_022075	AATTT	2	10	2271	2280	40 %	60 %	0 %	0 %	530567815
49	NC_022075	ATT	2	6	2455	2460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567815
50	NC_022075	TGA	2	6	2581	2586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567815
51	NC_022075	TTC	2	6	2654	2659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567815
52	NC_022075	TCG	2	6	2727	2732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567815
53	NC_022075	CTT	2	6	2769	2774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567815
54	NC_022075	GA	3	6	2782	2787	50 %	0 %	50 %	0 %	530567815
55	NC_022075	CAA	2	6	2794	2799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567815
56	NC_022075	CGG	2	6	2823	2828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567815
57	NC_022075	TCA	2	6	2843	2848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567815
58	NC_022075	GCTG	2	8	2884	2891	0 %	25 %	50 %	25 %	530567815
59	NC_022075	TTCA	2	8	2920	2927	25 %	50 %	0 %	25 %	530567815
60	NC_022075	AT	3	6	2935	2940	50 %	50 %	0 %	0 %	530567815
61	NC_022075	ATG	2	6	3027	3032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567815
62	NC_022075	CGG	2	6	3285	3290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567816
63	NC_022075	GAGC	2	8	3309	3316	25 %	0 %	50 %	25 %	530567816
64	NC_022075	CAA	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567816
65	NC_022075	CGC	2	6	3349	3354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567816
66	NC_022075	GTC	2	6	3412	3417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567816
67	NC_022075	GC	3	6	3483	3488	0 %	0 %	50 %	50 %	530567817
68	NC_022075	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567817
69	NC_022075	GAAG	2	8	3649	3656	50 %	0 %	50 %	0 %	530567817
70	NC_022075	TGA	2	6	3659	3664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
71	NC_022075	A	6	6	3703	3708	100 %	0 %	0 %	0 %	530567817
72	NC_022075	AGC	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
73	NC_022075	TCAG	2	8	3749	3756	25 %	25 %	25 %	25 %	530567817
74	NC_022075	GAG	3	9	3828	3836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530567817
75	NC_022075	AGC	2	6	3999	4004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
76	NC_022075	GAA	2	6	4093	4098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567817
77	NC_022075	AAAAGA	2	12	4191	4202	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530567817
78	NC_022075	ATT	2	6	4221	4226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567817
79	NC_022075	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
80	NC_022075	T	6	6	4250	4255	0 %	100 %	0 %	0 %	530567817
81	NC_022075	CAG	2	6	4297	4302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
82	NC_022075	ACG	2	6	4306	4311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567817
83	NC_022075	GAA	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567817
84	NC_022075	GAT	2	6	4384	4389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
85	NC_022075	GAT	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567817
86	NC_022075	CAC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530567817
87	NC_022075	AGTGA	2	10	4542	4551	40 %	20 %	40 %	0 %	530567817
88	NC_022075	GAC	2	6	4587	4592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567818
89	NC_022075	TCG	2	6	4615	4620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567818
90	NC_022075	GAA	2	6	4659	4664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567818
91	NC_022075	GACA	2	8	4671	4678	50 %	0 %	25 %	25 %	530567818
92	NC_022075	GAAA	2	8	4679	4686	75 %	0 %	25 %	0 %	530567818
93	NC_022075	AGT	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567818
94	NC_022075	CCGT	2	8	4695	4702	0 %	25 %	25 %	50 %	530567818
95	NC_022075	AT	4	8	4741	4748	50 %	50 %	0 %	0 %	530567818
96	NC_022075	GAA	2	6	4775	4780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567818
97	NC_022075	CAG	2	6	4877	4882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567819
98	NC_022075	ATG	2	6	4893	4898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567819
99	NC_022075	CAC	2	6	4985	4990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530567819
100	NC_022075	TCG	2	6	5004	5009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567819
101	NC_022075	ACA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567819
102	NC_022075	CGGT	2	8	5112	5119	0 %	25 %	50 %	25 %	530567819
103	NC_022075	GCC	2	6	5136	5141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567819
104	NC_022075	TCA	2	6	5154	5159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567819
105	NC_022075	CGG	2	6	5176	5181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567819
106	NC_022075	CGG	2	6	5212	5217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567819
107	NC_022075	TCCGGA	2	12	5386	5397	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	530567819
108	NC_022075	AAC	2	6	5410	5415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567819
109	NC_022075	AAG	2	6	5580	5585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567819
110	NC_022075	TTGCA	2	10	5643	5652	20 %	40 %	20 %	20 %	530567819
111	NC_022075	AAT	2	6	5693	5698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567819
112	NC_022075	AAG	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567819
113	NC_022075	GAT	2	6	5819	5824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567819
114	NC_022075	GA	3	6	5827	5832	50 %	0 %	50 %	0 %	530567819
115	NC_022075	ATT	2	6	5846	5851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567819
116	NC_022075	TCT	2	6	5942	5947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
117	NC_022075	CTT	2	6	5963	5968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
118	NC_022075	A	6	6	6038	6043	100 %	0 %	0 %	0 %	530567819
119	NC_022075	CGC	2	6	6059	6064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567819
120	NC_022075	TTC	2	6	6112	6117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
121	NC_022075	GCGG	2	8	6164	6171	0 %	0 %	75 %	25 %	530567819
122	NC_022075	GGGAC	2	10	6184	6193	20 %	0 %	60 %	20 %	530567819
123	NC_022075	TC	3	6	6265	6270	0 %	50 %	0 %	50 %	530567819
124	NC_022075	TCA	2	6	6360	6365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567819
125	NC_022075	TTA	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567819
126	NC_022075	TTC	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530567819
127	NC_022075	ATC	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530567819
128	NC_022075	GCC	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567819
129	NC_022075	GCA	2	6	6490	6495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567819
130	NC_022075	AGC	2	6	6528	6533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567819
131	NC_022075	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567819
132	NC_022075	AC	3	6	7016	7021	50 %	0 %	0 %	50 %	530567820
133	NC_022075	TCAG	2	8	7043	7050	25 %	25 %	25 %	25 %	530567820
134	NC_022075	TCCT	2	8	7063	7070	0 %	50 %	0 %	50 %	530567820
135	NC_022075	ATGA	2	8	7159	7166	50 %	25 %	25 %	0 %	530567820
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241	NC_022075	A	6	6	18412	18417	100 %	0 %	0 %	0 %	530567823
242	NC_022075	TACA	2	8	18468	18475	50 %	25 %	0 %	25 %	530567823
243	NC_022075	ATG	2	6	18542	18547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567823
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247	NC_022075	AAT	2	6	18841	18846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530567824
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253	NC_022075	GAA	2	6	19178	19183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567824
254	NC_022075	TAAA	2	8	19191	19198	75 %	25 %	0 %	0 %	530567824
255	NC_022075	GTT	2	6	19364	19369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530567824
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259	NC_022075	TGC	2	6	19474	19479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567824
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261	NC_022075	CTG	2	6	19497	19502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567824
262	NC_022075	TGA	2	6	19512	19517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567824
263	NC_022075	TTG	2	6	19596	19601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530567824
264	NC_022075	CGGG	2	8	19884	19891	0 %	0 %	75 %	25 %	530567825
265	NC_022075	ACG	2	6	19898	19903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567825
266	NC_022075	GCG	2	6	19906	19911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567825
267	NC_022075	GCC	2	6	19955	19960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530567825
268	NC_022075	ATT	2	6	19997	20002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530567825
269	NC_022075	GTC	2	6	20057	20062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530567825
270	NC_022075	TGA	2	6	20125	20130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567825
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282	NC_022075	TGA	2	6	20918	20923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567826
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286	NC_022075	TGA	2	6	21218	21223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567826
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290	NC_022075	CGG	2	6	21352	21357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530567826
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292	NC_022075	GCCG	2	8	21462	21469	0 %	0 %	50 %	50 %	530567826
293	NC_022075	CAA	2	6	21503	21508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530567826
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374	NC_022075	TTTG	2	8	26714	26721	0 %	75 %	25 %	0 %	530567831
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379	NC_022075	GA	3	6	26913	26918	50 %	0 %	50 %	0 %	530567832
380	NC_022075	GAA	2	6	26934	26939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530567832
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383	NC_022075	TGA	2	6	27227	27232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567832
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387	NC_022075	T	6	6	27318	27323	0 %	100 %	0 %	0 %	530567832
388	NC_022075	AAAG	2	8	27342	27349	75 %	0 %	25 %	0 %	530567832
389	NC_022075	AGT	2	6	27371	27376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567832
390	NC_022075	CAG	2	6	27894	27899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530567833
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392	NC_022075	AATG	2	8	28077	28084	50 %	25 %	25 %	0 %	530567833
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498	NC_022075	GA	3	6	37519	37524	50 %	0 %	50 %	0 %	530567840
499	NC_022075	CTGAT	2	10	37540	37549	20 %	40 %	20 %	20 %	530567840
500	NC_022075	GAT	2	6	37575	37580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530567840

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